多肽裂解儀是分析多肽序列和結構的關鍵設備，其正確使用過程涉及樣品制備、儀器參數設置、數據采集與解析等多個環節。以下是詳細的操作流程及注意事項：
1. 樣品制備要求
純度控制：確保多肽樣品純度＞95%，避免雜質干擾信號。若為混合物，需先進行分離純化（如反相色譜法）。
溶劑選擇：推薦使用揮發性緩沖液，避免非揮發性鹽類殘留導致離子源污染。對于難溶樣本，可加入少量有機溶劑助溶。
濃度優化：調至理想進樣濃度范圍，過低會導致信號弱，過高則可能引起離子抑制效應。可通過預實驗梯度稀釋確定最佳濃度。
還原烷基化處理：若樣品含二硫鍵，需用DTT或TCEP還原，再用碘乙酰胺烷基化以防止復性。
2. 標準品配置（定量分析時必需）
配制系列濃度梯度的標準曲線溶液，用于絕對定量方法的開發與驗證。注意避光保存并標注失效日期。
二、多肽裂解儀儀器開機與初始化
1. 啟動順序
依次打開氮氣發生器→質譜主機電源→計算機控制系統→真空系統（渦輪分子泵需預熱三十分鐘達到穩定轉速）。
關鍵指標監控：待真空度降且分子泵運行平穩后方可繼續操作。
2. 離子源調試
ESI源參數優化：毛細管電壓設為3.5kV左右，干燥氣流速調整，鞘氣流輔助脫溶劑。通過觀察實時總離子流圖（TIC）判斷噴霧穩定性——理想的錐孔電壓應產生連續穩定的Taylor錐形態。
納升噴霧模式適用場景：當樣本量極少時采用納噴針，此時需精細調節注射泵流速。
